Un codec de stockage ADN inspiré de la blockchain permet de récupérer des données à partir de séquences fortement endommagées.
Un codec de stockage ADN inspiré de la blockchain permet de récupérer des données à partir de séquences fortement endommagées.

Présentation du codec Gungnir et de son algorithme d’encodage. Crédit : Université de Hong Kong
Une équipe de recherche de la Faculté d’ingénierie de l’Université de Hong Kong (HKU), dirigée par le professeur Ruibang Luo de l’École d’informatique et de science des données et le professeur Can Li du Département de génie électrique et informatique, a développé Gungnir, un codec de stockage de données ADN inspiré de la technologie blockchain.
Ce système améliore la récupération d’informations numériques à partir de séquences d’ADN gravement endommagées, ce qui pourrait étendre la durée de vie pratique des archives de données ADN de moins d’une décennie à plusieurs siècles. L’article est publié dans la revue Nature Communications .
L’ADN est un support prometteur pour l’archivage à long terme. Il peut contenir d’immenses quantités d’informations dans un volume réduit, rester stable pendant des millénaires dans des conditions optimales et ne nécessite aucune énergie lors de sa conservation. Cependant, les molécules d’ADN peuvent se dégrader progressivement et accumuler des dommages au fil du temps, rendant la récupération des fichiers originaux de plus en plus difficile. Les codecs existants fonctionnent de manière optimale avec de l’ADN nouvellement synthétisé. Ils sont moins efficaces pour corriger les erreurs qui s’accumulent lors d’un stockage à long terme.
Gungnir propose une approche novatrice de la correction d’erreurs en appliquant des techniques de calcul basées sur la blockchain au stockage de données ADN. Ce système utilise une puissance de calcul considérable pour générer des reconstructions possibles des données originales et les vérifier jusqu’à l’identification des informations correctes.
Autrement dit, une puissance de calcul supérieure confère à Gungnir des capacités de correction d’erreurs renforcées. Cette conception permet à un disque ADN de tolérer des taux d’erreur allant jusqu’à 20 %, soit une amélioration de quatre fois par rapport aux méthodes existantes.

Performances de tolérance aux erreurs de Gungnir. Crédit : Université de Hong Kong
Cette technique permet de récupérer des données même à partir d’ADN fortement endommagé. Lors de tests extrêmes, Gungnir a réussi à récupérer des données sans perte à partir d’ADN présentant des niveaux de dommages comparables à ceux observés après environ 400 ans d’archivage.
Ceci pourrait étendre la durée de vie pratique d’un disque dur à ADN de moins d’une décennie à plusieurs siècles. Avec l’augmentation de la puissance de calcul, les performances de Gungnir pourraient s’améliorer, rendant potentiellement possible la préservation d’informations numériques dans l’ADN pendant des millénaires.


