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16 Mai, 2023

La lutte contre les bactéries buccales est élémentaire grâce à un outil de détection basé sur SHERLOCK

La lutte contre les bactéries buccales est élémentaire grâce à un outil de détection basé sur SHERLOCK

Des chercheurs ont mis au point un outil basé sur la technologie CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) qui permet de détecter rapidement les bactéries buccales à partir d’un échantillon de salive.

Grâce à un nouvel outil qui détecte les bactéries dans la salive à l’aide de SHERLOCK, l’évolution de CRISPR, vous pourrez peut-être bientôt quitter le dentiste après un examen avec des informations plus complètes sur la santé de votre bouche. Cet outil précis est beaucoup plus rapide que les méthodes existantes et pourrait permettre une détection et un traitement précoces des maladies de la bouche et d’autres maladies.

Des chercheurs de l’Institut Forsyth (dans le Massachusetts aux Etats-Unis) ont adapté la technologie CRISPR d’édition de gènes pour identifier les bactéries buccales en 30 minutes environ.

La santé bucco-dentaire est un indicateur clé de l’état de santé général. Des études antérieures ont montré que les micro-organismes présents dans la bouche jouent un rôle dans les maladies bucco-dentaires telles que les caries et les maladies des gencives. Il existe également un lien entre la santé bucco-dentaire et d’autres maladies, telles que les maladies cardiaques et respiratoires, le diabète et le cancer.

La technologie d’édition de gènes CRISPR est à l’origine de nombreuses avancées dans le domaine de la biomédecine. Évolution de CRISPR, SHERLOCK (Specific High-sensitivity Enzymatic Reporter unLOCKing) est un outil de diagnostic récemment apparu. Il peut détecter les empreintes génétiques uniques codées dans presque toutes les séquences d’ADN ou d’ARN de n’importe quel organisme ou pathogène.

Il fonctionne en programmant des enzymes CRISPR-Cas spéciales pour détecter un acide nucléique spécifique (impliqué dans le stockage et l’expression de l’information génomique). L’enzyme CRISPR-Cas est activée lorsque l’acide nucléique est identifié, ce qui génère un signal fluorescent.

L’enzyme Cas9 est généralement utilisée avec CRISPR. Ici, avec SHERLOCK, les chercheurs ont utilisé Cas13a pour cibler quatre bactéries connues pour être à l’origine de maladies bucco-dentaires. Les chercheurs affirment que c’est la première fois que SHERLOCK est appliqué à la détection de bactéries buccales.

« Les traitements ciblés ne sont possibles que si l’on sait quels insectes se trouvent dans la bouche », a déclaré Batbileg Bor, auteur correspondant de l’étude. « Actuellement, les tests disponibles sur le marché sont soit peu sensibles, soit nécessitent une analyse dans un laboratoire centralisé coûteux. Il faut parfois des mois pour obtenir les résultats. L’outil de détection étudié résout ces deux problèmes, en proposant des tests à haute sensibilité et à faible coût, avec des résultats rapides. »

Il suffit de cracher un échantillon de salive dans un tube. La salive peut être testée « telle quelle » et n’a pas besoin d’être nettoyée ou traitée avant le test. Les chercheurs ont testé leur nouvel outil sur 30 adultes souffrant de maladies médicales, dentaires et gingivales connues. Ils ont constaté que leur nouvelle méthode de détection était très sensible à la présence de bactéries.

« Le test est si sensible qu’il peut détecter aussi peu que quelques dizaines de cellules bactériennes d’un certain type à partir d’un échantillon qui pourrait contenir environ 200 espèces de bactéries que l’on trouve couramment dans la bouche », assure Batbileg Bor. « Nous avons pu cibler et détecter des bactéries spécifiques dans de la salive non traitée, ce qui signifie que nous avons pu obtenir ce niveau de sensibilité et de spécificité sans avoir à traiter davantage l’échantillon de salive.

En outre, les chercheurs ont utilisé leur outil de détection pour cibler trois bactéries associées à divers cancers, maladies digestives, maladies cardiovasculaires et maladies neurodégénératives. Ils ont constaté que l’outil pouvait détecter des biomarqueurs de la salive, y compris des marqueurs inflammatoires et cancéreux.

Selon les chercheurs, l’élimination de l’équipement complexe nécessaire aux procédures de test actuelles signifie que la santé bucco-dentaire d’une personne pourrait être vérifiée de manière complète pendant qu’elle se trouve dans le cabinet du dentiste pour un contrôle ou une obturation.

« Une fois que cet outil sera pleinement développé, il changera votre expérience dentaire », a déclaré Wenyuan Shi, l’un des coauteurs de l’étude. « Pendant que vos dents sont nettoyées, le dentiste peut également vous fournir toutes les informations biologiques relatives à votre santé bucco-dentaire et à votre santé générale.

https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/20002297.2023.2207336

https://www.forsyth.org/news/crispr-based-rapid-detection/